Istnieją trzy techniki usuwania endometriozy przy pomocy operacji. Jedną z nich jest elektrokoagulacja wykonywana za pomocą elektrod koagulujących, czyli prądu elektrycznego. Następną z metod jest wycinanie wykonywane za pomocą nożyczek lub skalpela. Trzecią z kolei jest waporyzacja dokonywana za pomocą noża plazmowego lub lasera, który posiada odpowiednie właściwości.
W przypadku elektrokoagulacji procedurę wykonuje się przy użyciu mono- lub bi-polarnych elektrod. Jest to metoda uchodząca za najprostszą, nie wymagającą specjalistycznych narzędzi, dlatego też jest stosowana najczęściej. Należy jednak przy tym odnotować pewną uwagę, ponieważ badania dowiodły, że w zwęglonej tkance nadal mogą występować aktywne gruczoły endometrialne, które mają zdolność do wznowienia choroby, przy czym to już w pierwszych miesiącach po operacji. Jedną z kolejnych wad elektrokoagulacji jest pewna zdolność negatywna metody prowadzącej do uszkodzenia tkanki leżącej pod ogniskiem endometrialnym, sięgając do 1 cm. Nabiera to wymiaru szczególnie znaczącego podczas koagulacji jajnika, powodując bowiem dość znaczne zmniejszenia rezerwy jajnikowej, a co za tym idzie, obniżenie płodności.